
DeepMind 发布人类基因组 AI 图谱:可直接查询约 90 亿种 DNA 变化
Google DeepMind 发布 AlphaGenome Atlas,将人类基因组中约 90 亿种可能的单字母 DNA 变化提前计算完成,并整理成可直接搜索的数据库。整个数据集约 1PB,比 AlphaFold Database 大 30 多倍。
人类基因组约有 30 亿个 DNA 字母,每个位置都可能替换为另外 3 种,因此总计约 90 亿种单字母变化。过去,研究人员需要使用 AlphaGenome 单独分析变异;现在可直接在 Atlas 中查询结果,无需每次重新运行模型。
Atlas 还为每个变异提供 AVI 分数,综合 AlphaGenome 与 AlphaMissense 的预测结果,帮助研究人员优先识别最可能产生影响的变异。其覆盖范围不仅包括约 2% 的蛋白质编码区域,也包括更难研究的约 98% 非编码区域。
已有研究团队借助该数据库发现此前遗漏的罕见病相关变异,并通过实验确认其中一个变异确实会导致 RNA 剪接异常。
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